תוכנית לבניית שכונה נוספת במגדל העמק, על אדמות שהינן כרגע חקלאיות, הולידה מחלוקת משפטית בין וועדת מרחבית יזרעאלים לבין עיריית מגדל העמק: הבעלים של הקרקע עתר לוועדת הערר המחוזית של מחוז צפון כנגד שתיהן במטרה לקבל פיצוי בגין הפקעת הקרקע עבור בניית השכונה – אולם הכרעת הוועדה, שהתקבלה לפני מספר שבועות, הותירה על כנה רק את התביעה נגד המועצה האזורית עמק יזרעאל באמצעות וועדת יזרעאלים.

הפרשה החלה בעקבות אישור תוכנית שקידמו משרד השיכון ועיריית מגדל העמק להקמת שכונה חדשה בעיר – "שכונה מערבית שלב ב'". על פי התוכנית שאושרה ב-2021, ייבנו 2,914 דירות ל-1,785 שאושרו בשלב א', והיא תחול בין השאר על שטחים חקלאיים בעמק יזרעאל, המצויים בתחום שיפוטה של הוועדה המרחבית יזרעאלים, שם ממוקמות קרקעותיו של התובע.

בעקבות אישור התוכנית, הגיש בעל קרקע חקלאית תביעת פיצויים בגין ירידת ערך נגד שתי ועדות מקומיות – מגדל העמק ויזרעאלים. שתי הרשויות המקומיות הגיבו לתביעה בבקשה לדחות על הסף את תביעת הפיצויים והטילו את האחריות זו על זו. בעקבות זאת פנה העורר לוועדת הערר, שנדרשה להחליט מי מבין המועצות אחראית לשאת בסכום הפיצוי או שמע יש לחלקו בין שתיהן. סכום התביעה שהוגש הינו כ-12 מיליון שקלים.

בדיון בעתירה, וועדת יזרעאלים טענה כי מי שאחראית לפצות את בעלי הקרקע היא מגדל העמק, מאחר והיא יוזמת התוכנית ומקימה שכונה חדשה בתחומה.

מנגד טענה עיריית מגדל העמק, באמצעות עו"ד אמיר בירנבוים ממשרד עפר שפיר ושות', כי האחריות לדיון בתביעה ולפיצוי היא של הוועדה המרחבית יזרעאלים, כיוון שהקרקע הייתה ונותרה במועד התוכנית בתחומה, וכן לאור הסדרי שיפוי אליהם הגיעה מול רשות מקרקעי ישראל במסגרת הליכי התכנון, שלפיהם במקרה שתוגש תביעה נגדה, רמ"י תישא בתשלום הפיצוי.

בעל הקרקע טען מצידו כי היה די להגיש את התביעה ליזרעאלים, אבל  למד כי גבול השיפוט בין הוועדות המקומיות האמורות שונה ותוקן כך שגבול השיפוט יותאם לגבול המוצע בתכנית הכוללנית למגדל העמק.

לאחר דיון בוועדת הערר, שבחנה את עניין שינוי הגבולות בין עמק יזרעאל למגדל העמק, היא הגיעה למסקנה כי יש לדחות את התביעה נגד מגדל העמק וכי מי שתדון בפיצוי לבעלי הקרקע היא יזרעאלים, וזאת מכיוון שהוועדה המחוזית במחוז צפון קבעה התנייה לתוכנית בכך שיינתן כתב שיפוי לטובת יזרעאלים – משמע הוועדה המחוזית סברה שהתביעה תוגש ליזרעאלים.

בהחלטת וועדת הערר נכתב, בין השאר: "החלטת הוועדה המחוזית להתנות את אישורה של התכנית בהמצאת כתב שיפוי לטובת יזרעאלים… מעידה יותר מכל כי אף הוועדה המחוזית סברה כי את תביעת פיצויים בגין המקרקעין דנן יש להגיש לוועדה המקומית יזרעאלים. אין בלבנו ספק כי המקרקעין נשוא ערר זה מצויים בתחום המרחב התכנוני של הוועדה מקומית יזרעאלים והיא הוועדה המקומית אליה יש להגיש את תביעת הפיצויים דנן והיא זו האמורה לדון בה". לא נקבע צו להוצאות.